９８/９９シーズンまでのカップウィナーズ・カップと旧ＵＥＦＡカップが統合され、１９９９/２０００から新しい形式「ＵＥＦＡカップ」が開催されるようになりました。
ＵＥＦＡランキングに基づいて各国リーグ戦の上位チーム、カップ戦チャンピオン、インタートト・カップ（毎夏に行われる欧州クラブ対抗戦）を勝ち抜いた３チーム、ＵＥＦＡが投票するフェアプレー賞獲得ポイントの上位３カ国から１チームずつ、など参加資格は非常に複雑です。
２００１／２００２シーズンの予選からの参加チームは８２チーム。１回戦からの参加は５５チーム。
さらに３回戦からはチャンピオンズリーグ１次リーグからのコンソレーションで８チームが加わるため参加総数は１４５チームを数えるビッグな大会です。
強豪クラブチーム同士の対決、または小さなクラブチームとの対決を見られる、という良い点もあります。
チャンピオンズリーグとは異なり全てH&A方式のノックアウト（トーナメント）形式で行われます。
チャンピオンズリーグに比べるとやや注目度は低いと見られていますが、両カップのの王者が対戦するヨーロッパスーパーカップでは４年連続でチャンピオンズリーグの王者は敗れています。
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